Dizi Hizalama Algoritması, Dünyanın Mikrobiyal DNA’sının Hızlı Bir Şekilde Aranmasını Sağlıyor

📌Times of Defence Yazarı Mehmet Uslu:

1️⃣Nature Biotechnology’de tanıtılan LexicMap, milyonlarca mikrobiyal genom arasında DNA dizilerini ve mutasyonları dakikalar içinde arayabilen yeni bir dizi hizalama algoritmasıdır. Bu, geleneksel yöntemlere kıyasla çok daha hızlı ve düşük hesaplama yüküyle çalışır.
2️⃣LexicMap, Avrupa Nükleotid Arşivi’ndeki (ENA) 2,4 milyon bakteri ve arke genomunu indeksleyerek araştırmacıların antibiyotik direnci, salgın takibi ve mikrobiyal çeşitlilik gibi konularda küresel veri havuzunu etkin biçimde taramasını sağlar.
3️⃣LexicMap, AllTheBacteria projesine entegre edilmiştir. Bu proje, bilinen tüm bakteri genomlarını yüksek kaliteli biçimde derleyip indeksleyerek araştırmacılara en büyük mikrobiyal DNA koleksiyonuna erişim sunar.
4️⃣LexicMap, biyolojide Google aramasına benzer bir işlev görerek yeni keşfedilen genlerin veya mutasyonların dünya genelindeki yaygınlığını birkaç dakika içinde analiz etmeye olanak tanır. Bu, ilaç geliştirme ve halk sağlığı araştırmaları için kritik bir avantajdır.
5️⃣LexicMap sayesinde epidemiyoloji, evrimsel biyoloji ve ekoloji gibi alanlarda büyük veriyle çalışmak artık mümkün. Tüm halka açık mikrobiyal genomların hızlı taranabilirliği, bilimsel keşiflerin ve müdahale stratejilerinin hızını artırıyor.